vinelinux 6.3 へのfreefem++-3.38のインストールメモ

有限要素法を用いた偏微分方程式を解くプログラムであるfreefem++のインストールメモ
（１）事前準備
# apt-get install lapack lapack-devel lapack-static
# apt-get install mesa-libGLU-devel

（２）事前準備
$ tar zxvf freeglut-2.8.1.tar.gz
$ cd freeglut-2.8.1
$ ./configure
$ make
# make install


（３）事前準備
$ tar zxvf openmpi-1.8.5.tar.gz
$ cd openmpi-1.8.5
$ ./configure
$ make
# make install


$ tar gsl-1.16.tar,gz
$ cd gsl-1.16
$ ./configure
$ make
# make install

（４）インストール作業
$ tar zxvf freefem++3.38.tar.gz
$ cd freefem++-3.38
$ ./configure --with-mpi=mpic++ --enable-download F77=g77
$ download/getall

vinelinux では、F77=g77 としないと、以下のファイルが参照ができないというエラーがでる。
more undefined references to `z_abs' follow
fortranのコンパイラにgfortarnとgcc-g77をインストールしているときは、gfortranが使わるので、F77=g77 としておくとうまく行った。


（3.37-1では、エラーがでる）
ERROR: ../build/download http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/SuiteSparse/SuiteSparse-4.3.1.tar.gz pkg/SuiteSparse-4.3.1.tar.gz FAILED

そこで以下のところからファイルを持って来て、download/pkgにコピーする
http://pkgs.fedoraproject.org/repo/pkgs/suitesparse/SuiteSparse-4.3.1.tar.gz/f8f26a3b1c7f82444c0db0b375215287/

$ download/getall

$ make
$ make check

freefem++-3.38/examples++-load' に入ります
XFAIL: PARDISO.edp

freefem++-3.38/examples++-mpi' に入ります
XFAIL: schwarz.edp
XFAIL: Stokes-v1-matrix-mumps.edp
XFAIL: Stokes-v2-matrix-mumps.edp
XFAIL: testsolver_pastix.edp
XFAIL: diffusion-3d.edp
XFAIL: elasticity-3d.edp

=========================
Testsuite summary for FreeFem++ 3.38
=========================
# TOTAL: 35
# PASS: 34
# SKIP: 0
# XFAIL: 1
# FAIL: 0
# XPASS: 0
# ERROR: 0
=============

# make install

tutorial
$ cd /usr/local/share/freefem++/3.38/

ホームデイレクトリにディレクトリexamples++-をコピーしてきてall,edpファイルを実行してみた．
$ cp -r examples++ ~/
$ chown -R user ~/examples++
$ cd ~/examples++
$ FreeFem++ all.edp

また，ホームデイレクトリにディレクトリexamples++-tutorialをコピーしてきてall,edpファイルを実行してみた．
$ cp -r examples++-tutorial ~/
$ chown -R user ~/examples++-tutorial
$ cd ~/examples++-tutorial
$ FreeFem++ all.edp

vinelinux6.1(x86_64)にtgifをインストール(メモ)

vinelinux6.1にtgifをインストールしたときのメモです。

システムの情報
# uname -a
Linux localhost.localdomain 3.0.50-1vl6 #1 SMP Thu Nov 1 09:06:42 JST 2012 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

Linuxのバージョン
# cat /etc/vine-release
Vine Linux 6.1 (Pape Clement)

Vine6.0(x86_64)でtgifを使う話のページを参考に事前準備として、以下の作業を行った。

# apt-get install TrueType-ipafont-mincho
# apt-get install xorg-x11-fonts-base
# cd /usr/share/fonts/X11/encodings/
# mkfontdir -n -r -e . -e large
# mktcapdir /usr/share/fonts/TrueType-ipafont /usr/share/fonts/TrueType-ipafont/*.ttfconf


(1)　利用可能なパッケージの検索
# apt-cache search tgif
pstoedit - ポストスクリプトやPDFを多種多様なベクタ形式に変換
tgif - 2次元ドローイングソフト
tgif2tex - tgif の図中の文字列を TeX で処理する

(2)インストール
# apt-get install tgif

(3) Warning: No type converter registered for 'String' to 'Bitmap' conversion.という警告がでるので、
/usr/share/X11/ja/app-defaults/Tgif
の以下の部分をコメントした。
!Tgif.IconPixmap: /usr/share/tgif/tgificon.xpm

(4)英字フォントの大きさを変えることができなくなっているのでVine6.0(x86_64)でtgifを使う話のページを参考に

/usr/share/X11/ja/app-defaults/Tgif
に以下を追加した。

Tgif.HasAlternateDefaultFonts: true

Tgif.Times-Roman: -urw-nimbus roman no9 l-medium-r-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Times-Bold: -urw-nimbus roman no9 l-bold-r-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Times-Italic: -urw-nimbus roman no9 l-medium-i-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Times-BoldItalic: -urw-nimbus roman no9 l-bold-i-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1

Tgif.Courier: -urw-nimbus mono l-medium-r-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Courier-Bold: -urw-nimbus mono l-bold-r-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Courier-Oblique: -urw-nimbus mono l-medium-o-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Courier-BoldOblique: -urw-nimbus mono l-bold-o-*-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1

Tgif.Helvetica: -urw-nimbus sans l-medium-r-normal-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Helvetica-Bold: -urw-nimbus sans l-bold-r-normal-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Helvetica-Oblique: -urw-nimbus sans l-medium-o-normal-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.Helvetica-BoldOblique: -urw-nimbus sans l-bold-o-normal-*-%d-*-*-*-*-*-iso8859-1

Tgif.NewCenturySchlbk-Roman: -urw-century schoolbook l-medium-r-normal--%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.NewCenturySchlbk-Bold: -urw-century schoolbook l-bold-r-normal--%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.NewCenturySchlbk-Italic: -urw-century schoolbook l-medium-o-*--%d-*-*-*-*-*-iso8859-1
Tgif.NewCenturySchlbk-BoldItalic: -urw-century schoolbook l-bold-o-*--%d-*-*-*-*-*-iso8859-1

Tgif.Symbol: -urw-standard symbols l-medium-r-normal--%d-*-*-*-*-*-adobe-fontspecific